姓名

张媛媛

单位部门

信息与控制工程学院

公共基础教研室

职称

副教授

电话/邮箱

yyzhang1217@163.com

个人简介

张媛媛，副教授，中国石油大学（华东）地质资源与地质工程流动站博士后，CCF和CAA会员。主要研究方向为机器学习等在生物组学数据和复杂疾病中的应用，基于人工智能的智慧医疗等方面的研究。现任公共基础教研室主任，主持国家自然科学青年基金1项，山东省自然科学基金1项，作为主要参与人参与国家自然科学基金2项、山东省自然科学基金2项，高等学校博士学科点专项科研基金1项。发表SCI论文20余篇，影响因子总和超30，其中以第一和通讯作者发表SCI论文7篇。主要承担大学计算机，程序设计基础（C语言），离散数学等理论教学任务。荣获山东省信息化教学比赛二等奖1项，校青年讲课比赛二等奖1项，校“三八红旗手”称号。

研究领域

1.计算生物信息学

2.机器学习

3.生物组学数据挖掘

4.网络表示学习

教科研情况

课程教学：

本科课程：《大学计算机》、《程序设计基础A（C语言）》、《离散数学》

研究生课程：《大数据技术》

主要科研项目：

1.国家自然科学基金，样本特异性基因功能模块挖掘的多源信息融合方法研究，23万，在研，主持；（2020.01-2022.12）

2.山东省自然科学基金，基于数据特征整合的差异甲基化模式识别方法研究，5万，在研，主持；（2018.03-2020.06）

3.山东省自然科学基金，基于机器学习与小波变换融合的复杂储层特征识别研究，5万，在研，第二参与人；（2019.07-2022.06）

4.山东省自然科学基金，基于统计学习的模式分布分析算法在高维复杂数据中的应用，15万，在研，第一参与人；（2019.07-2022.06）

5.国家自然科学基金，基于新一代测序数据的肿瘤纯度及倍体动态预测方法研究，60万，在研，第四参与人；（2016.01-2019.12）

6.国家自然科学基金，复杂基因逻辑网络若干理论和应用研究，59万，结题，第六参与人。（2012.01-2015.12）

学术成果

代表性论文：

1.Shudong Wang, Lihua Wang,Yuanyuan Zhang*,Shanchen Pang, Xinzeng Wang. PEIS: a novel approach of tumor purity estimation by identifying information sites through integrating signal based on DNA methylation data. BMC bioinformatics. 2019, 20 (s20) :714.(SCI, IF=2.511, JCR:2)

2.Yuanyuan Zhang^*, Chuanhua Kou, Shudong Wang, Yulin Zhang.Genome-wide differential-based analysis of the relationship between DNA methylation and gene expression in cancer. Current Bioinformatics, 2019, 14: 783-792.(SCI, IF=1.189, JCR: 4)

3.Yuanyuan Zhang^*, Shudong Wang, Xinzeng Wang.Data-Driven-Based Approach to Identifying Differentially Methylated Regions Using Modified 1D Ising Model. BioMed Research International. Volume 2018, Article ID 1070645, 8 pages, 2018. (SCI, IF: 2.583, JCR: 3)

4.Yuanyuan Zhang, Junying Zhang*, Junliang Shang.Quantitative identification of differentially methylated loci based on relative entropy for matched case-control data. Epigenomics-UK. 5(6): 631-643, 2013.(SCI, IF:5.215, JCR: 1)

5.Yuanyuan Zhang, Junying Zhang*.Identification of functionally methylated regions based on discriminant analysis through integrating methylation and gene expression data. Molecular BioSystems.11(7):1786-1793,2015.(SCI, IF:3.183, JCR: 3)

6.Yuanyuan Zhang, Junying Zhang*, Zhaowen Liu, Yajun Liu, Shouheng Tuo. A network-based approach to identify disease-associated gene modules through integrating DNA methylation and gene expression. Biochemical and Biophysical Research Communications (BBRC). 465(3): 437-442, 2015. (SCI, IF:2.297, JCR: 3)

7.Shudong Wang, Xinzeng Wang ,Qifang Song,Yuanyuan Zhang. High-Order Degree and Combined Degree in Complex Networks. Mathematical Problems in Engineering. Volume 2018, Article ID 4925841, 12 pages. 2018.(SCI, IF: 1.145, JCR:3)

8.Yajun Liu, Junying Zhang, Aimin Li,Yuanyuan Zhang, Yaoyao Li, Xiguo Yuan, Zongzhen He, Zhaowen Liu. Identification of PIWI-interacting RNA modules by weighted correlation network analysis. Cluster Computing, 2017.(SCI, IF: 2.04, JCR: 4)

9.Shouheng Tuo, Junying Zhang*,Xiguo Yuan,Yuanyuan Zhang, Zhaowen Liu. FHSA-SED: Two-Locus Model Detection for Genome-Wide Association Study with Harmony Search Algorithm. PloS One, 11(3):e0150669, 2016.(SCI, IF: 2.806, JCR: 3)

10.Zhaowen Liu, Junying Zhang*, Xiguo Yuan, Baobao Liu, Yajun Liu, Aimin Li,Yuanyuan Zhang, Xiaohan Sun, Shouheng Tuo. Detecting Pan-cancer Conserved MicroRNA Modules from MicroRNA Expression Profiles across Multiple Cancers. Molecular BioSystems.11, 2227 - 2237, 2015.(SCI, IF: 3.183, JCR: 3)

奖励与荣誉

1.山东省信息化教学比赛二等奖

2.青岛理工大学青年讲课比赛二等奖

3.青岛理工大学校级“三八红旗手”